Endoskopi ünitesi, hastanemiz D blok B1 katında hizmet vermektedir.3 işlem odası,1 skop yıkama dezenfeksiyon odası,6 yataklı derlenme (pre-op ve post-op) odası bulunmaktadır. Dezenfeksiyon odasında 5 adet yıkama makinesi,3 adet skop saklama dolabı vardır. İşlem odalarında, 5 adet endoskopi sistemi, bunlara ait 9 gastroskop, 9 kolonoskop ve 2 adet duedonoskop bulunmaktadır. Aynı anda Gastroenteroloji ve Genel Cerrahi uzmanı işlem yapmaktadır. Endoskopi ünitesinde; kolonoskopi, gastroskopi, rektoskopi, Peg (perkütan endoskopik beslenme tüpü ) takılması, ERCP, karaciger biyopsisi, parasentez, özefagusdilatasyonu,Gis kanamalara acil müdahale, özefagustan ve mideden yabancı cisim çıkarılması işlemleri yapılmaktadır. Endoskopi ünitesinde, Gastroenteroloji uzmanı, Genel Cerrahi uzmanı, Hemşire, Anestezi Teknisyeni ve diğer personeller ile hizmet vermektedir.